Optimisation of Xenium automated in situ sequencing for PAXgene-fixed tissue samples
Cette étude présente un flux de travail optimisé utilisant un nouveau protocole de digestion à base de pepsine (XTO) pour adapter avec succès la plateforme de séquençage in situ automatisée Xenium aux tissus fixés au PAXgene, démontrant que ces échantillons peuvent atteindre une détection spatiale des transcrits d'ARN comparable ou supérieure à celle des échantillons FFPE standards tout en préservant la morphologie tissulaire.